通州地区饮用水紧张问题由来已久，每到夏季用水高峰期，严重缺水情况常见于新闻报道，地下水虽然很丰富，但浅层水污染严重，200多米的机井出水仍带有浓重的味道，严重影响了通州区的生产生活，百姓反映强烈。随着通州作为北京副中心的进程加快，解决通州地区用水紧张问题更加迫切。

为了缓解城市副中心用水紧张问题，2012年9月27日，通州区政府与北京南水北调工程投资中心（后更名“北京水务投资集团有限公司”）签订北京市南水北调配套工程通州水厂项目一期工程《战略合作框架协议》，约定双方共同出资组建项目公司负责通州水厂的投资、建设和运营工作。

2014年3月12日，项目公司即北京京通水务有限公司注册成立，开始筹备建设通州水厂。 京通公司注册资金3000万元，北京水务投资集团有限公司出资1800万元，占60%股份；大运河（北京）水务建设投资管理有限公司代表区政府出资1200万元，占40%股份。

公司主营业务包括城市园林绿化、供水项目投资、企业管理服务、水污染治理、技术推广等。 京通公司目前有党群工作部、综合管理部、企业发展部、计划合同部、财务部、工程管理部、安保部等7个职能部门，现有22名正式职工和1名劳务人员。

通州水厂总占地（含调节池）约30公顷，规划总规模60万立方米/日，分三期建设，一期规模为20万立方米/日。 2014年12月18日，通州区水务局与京通公司签订《建设管理委托合同》后，京通公司启动水厂建设工作。

南水北调通州水厂设计工期23个月，委托合同工期18个月。2015年9月正式开工建设，为尽早解决通州地区用水紧张问题，京通公司克服了时间紧、任务重等诸多困难，拔丁抽楔、迎难而上，只用10个月的时间于2016年6月底完成水厂主体工程建设，开始进水调试。同年11月，完成调试，获得国家实验室国标106项水质合格检测报告，2017年3月获得集中式供水《卫生许可证》（城市公共供水）。

2017年7月，通州水厂正式对外供水，截止到2023年8月，通州水厂已安全平稳对外供水6年，极大地缓解了通州地区饮用水紧张问题。